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动脉粥样硬化斑块的单细胞CITEseq [复制链接]

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考虑到咱们生信技能树粉丝对单细胞数据挖掘的需求,我开通了一个专栏《个单细胞转录组数据降维聚类分群图表复现》,也亲自示范了几个,不过自己带娃,读博,时间精力有限,所以把剩余的90多个任务安排了学徒,实习生,学员。真的是太棒了,群策群力!

下面七月份学徒的投稿

今天介绍的文章是年10月发表在NatureMedicine杂志《Single-cellimmunelandscapeofhumanatheroscleroticplaques》文章链接是:

该研究主要发现AS患者的斑块中存在CD4+T细胞的独特亚群以及被激活和分化的T细胞群,且与斑块易损性相关亚群的巨噬细胞表现出选择性激活的表型。另外,硬化斑块会高表达PD-1(程序性细胞死亡蛋白1)而使T细胞发生耗竭后的重编程。最后,作者提出对于患有潜在心血管疾病的癌症患者,PD-1抑制剂的使用可能增加心血管疾病风险。

这篇文章主要是进行免疫分析,采用了CITE-seq和scRNA-seq。数据存储在:Single-Cell-Immune-Profiling-of-Atherosclerotic-Plaques(figshare.

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